Mikako Nagamine, viene reclutata dall’esercito dell’ONU per combattere degli invasori alieni.
L’unico suo collegamento con la Terra sono le E-mail che si scambia con l’amico, ma con i salti spazio temporali, il tempo di recezione dei messaggi si fa sempre più lungo.
Il Giappone dopo la seconda guerra mondiale è diviso in due parti, una parte sotto il blocco degli Stati Uniti e una legata all'Unione Sovietica. Negli anni novanta il paese si riunisce e soltanto Hokkaidō rimane occupata dai sovietici, i quali costruiscono una torre smisurata che è in realtà un'arma in grado di trasformare il mondo in un universo completamente differente.
Weathering With You rappresenta un ulterirore emozionante e poetico capitolo nella carriera di Makoto Shinkai, che ricolpisce lo spettatore al cuore grazie alle sue storie create con persone imperfette che sono alla ricerca di sentimenti reali, emozioni e perfino di sé stesse.